Российский браузер для укрепления иммунитета

Print 17 Октября 2016
Marchmont Innovation News

Ученые из Института биоорганической химии РАН разработали многофункциональный браузер VDJviz для работы с большими объемами данных, получаемых с помощью современных средств анализа последовательностей ДНК. Разработка позволит ускорить развитие иммуногеномики. Статья о результатах работы  опубликована на английском языке  в журнале BMC Genomics.

По словам одного из авторов статьи Ивана Звягина, программа получила свое название — VDJviz — от названия групп фрагментов генома, из которых формируются зрелые гены рецепторов В- и Т-клеток иммунной системы, а также антител: V — variable, D — diversity и J — joining. 

«Сложный процесс созревания таких генов, называемый V(D)J-рекомбинация, лежит в основе формирования адаптивного иммунитета — защитной системы организма, теоретически способной противостоять любому встречаемому патогену и предотвращать развитие опухолей», — сказал ученый. 

Современные методы молекулярной биологии позволяют определять кодирующие последовательности этих гипервариабельных рецепторов и иммуноглобулинов. Обработка таких данных с помощью различных инструментов биоинформатики помогает исследователям восстанавливать репертуары клеток системы адаптивного иммунитета. VDJviz помогает эффективно решать эту задачу — программа не требует специальных навыков программирования и доступна любому биологу. 

По словам г-на Звягина, проект поможет в разработке «новых методов терапии болезней аутоиммунного и онкологического характера, а также аллергий».

Источник

Вернуться к разделу